Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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