Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDRF1Q3B7T1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EDRF1Q3B7T1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms