Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROSER3Q2NL68 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROSER3Q2NL68 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms