Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms