Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ISXQ2M1V0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms