Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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