Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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