Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NDUFA9Q16795 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA9Q16795 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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