Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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