Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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GRIK5Q16478 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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