Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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