Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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