Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CHD4Q14839 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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