Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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