Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB2AQ13885 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB2AQ13885 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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