Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PKP1Q13835 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PKP1Q13835 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PKP1Q13835 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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