Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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