Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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