Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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