Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROD1Q13562 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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