Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms