Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP140Q13342 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP140Q13342 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP140Q13342 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP140Q13342 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP140Q13342 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SP140Q13342 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms