Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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