Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms