Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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