Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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