Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms