Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms