Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms