Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms