Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms