Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms