Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms