Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms