Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms