Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLCB3Q01970 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms