Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms