Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms