Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms