Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1BQ00975 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms