Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK3Q00526 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms