Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms