Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms