Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAG1P78504 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAG1P78504 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAG1P78504 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms