Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-24P63145 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms