Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms