Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK-21P61565 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms