Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms