Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMFBP60983 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms