Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms